重建
介紹
醫學影像3D重建是建構虛擬生理人(VPH)的重要步驟,特別是大腦多孔力學模型的建立,其便是透過磁振造影(MR)影像資料,量測腦實質和腦室系統的3D幾何結構,再重建出大腦網格模型。醫學影像3D重建可透過開源軟體實現,其步驟為影像分割與重建輸出。在分割步驟中,我們透過半自動演算法獲得速度影像(Speed image),並透過影像分類演算法,如:基於高斯混合模型的分群、監督式的隨機森林分類、主動輪廓模型、邊界偵測。將影像分成前景與背景。前景是指感興趣區域,其在速度影像中值為1;背景則是不感興趣區域,其值為0。重建輸出步驟中,我們需要確定體素的尺寸是否貼近真實,則開源軟體可根據先前標記結果輸出表面網格。下圖便是透過此重建方案成功建立的 3D 人類大腦和大鼠大腦。
人體心室系統
人腦
大鼠大腦
大鼠大腦